Никулин Алексей Донатович

к.х.н. , ИБ РАН

Список статей

        1. Ennifar E, Nikulin A, Tishchenko S, Serganov A, Nevskaya N, Garber M, Ehresmann B, Ehresmann C, Nikonov S, Dumas P The crystal structure of UUCG tetraloop // JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY.- 2000.- Vol. 304, № 1.- P. 35-42.
        2. Loseva OI, Tiktopulo EI, Vasiliev VD, Nikulin AD, Dobritsa AP, Potekhin SA Structure of Cry3A delta-endotoxin within phospholipid membranes // Biochemistry.- 2001.- Vol. 40, № 47.- P. 14143-14151.
        3. Mamaeva DV, Morozova EA, Nikulin AD, Revtovich SV, Nikonov SV, Garber MB, Demidkina TV Structure of citrobacter freundii L-methionine gamma-lyase // Acta Crystallogr. F.- 2005.- Vol. 61, № 6.- P. 546-549.
        4. Garber M, Gongadze G, Meshcheryakov V, Nikonov O, Nikulin A, Perederina A, Piendl W, Serganov A, Tishchenko S Crystallization of RNA/protein complexes // Acta crystallogr. D.- 2002.- Vol. 58, № 10.- P. 1664-1669.
        5. Nevskaya N, Tishchenko S, Gabdoulkhakov A, Nikonova E, Nikonov O, Nikulin A, Platonova O, Garber M, Nikonov S, Piendl W Ribosomal protein L1 recognizes the same specific structural motif in its target sites on the autoregulatory mRNA and 23S rRNA // NUCLEIC ACIDS RESEARCH.- 2005.- Vol. 33, № 2.- P. 478-485.
        6. Nevskaya N, Tishchenko S, Nikulin A, Al-Karadaghi S, Liljas A, Ehresmann B, Ehresmann C, Garber M, Nikonov S Crystal structure of ribosomal protein S8 from Thermus thermophilus reveals a high degree of structural conservation of a specific RNA binding site // JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY.- 1998.- Vol. 279, № 1.- P. 233-244.
        7. Nevskaya N, Tishchenko S, Volchkov S, Kljashtorny V, Nikonova E, Nikonov O, Nikulin A, Kohrer C, Piendl W, Zimmermann R, Stockley P, Garber M, Nikonov S New insights into the interaction of ribosomal protein L1 with RNA // JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY.- 2006.- Vol. 355, № 4.- P. 747-759.
        8. Nikonov O, Stolboushkina E, Nikulin A, Hasenohrl D, Blasi U, Manstein DJ, Fedorov R, Garber M, Nikonov S New insights into the interactions of the translation initiation factor 2 from archaea with guanine nucleotides and initiator tRNA // JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY.- 2007.- Vol. 373, № 2.- P. 328-336.
        9. Nikonov S, Nevskaya N, Eliseikina I, Fomenkova N , Nikulin A , Ossina N, Garber M, Jonsson B.-H., Briand C, Al-Karadaghi S, Svensson A, Aevarsson A, Liljas A Crystal structure of the RNA binding ribosomal protein L1 from Thermus thermophilus // EMBO J..- 1996.- Vol. 15, № 6.- P. 1350-1359.
        10. Nikonov SV, Nevskaya NA, Fedorov PV, Khairullina AR, Tishchenko SV, Nikulin AD, Garber MB Structural studies of ribosomal proteins // Biol. Chem..- 1998.- Vol. 379, № 7.- P. 795-805.
        11. Nikulin A, Eliseikina I, Tishchenko S, Nevskaya N, Davydova N, Platonova O, Piendl W, Selmer M, Liljas A, Drygin D, Zimmermann R, Garber M, Nikonov S Structure of the L1 protuberance in the ribosome // NATURE STRUCTURAL BIOLOGY.- 2003.- Vol. 10, № 2.- P. 104-108.
        12. Nikulin A, Revtovich S, Morozova E, Nevskaya N, Nikonov S, Garber M, Demidkina T High-resolution structure of methionine gamma-lyase from Citrobacter freundii // Acta crystallogr. D.- 2008.- Vol. 64, № 2.- P. 211-218.
        13. Nikulin A, Serganov A, Ennifar E, Tishchenko S, Nevskaya N, Shepard W, Portier C, Garber M, Ehresmann B, Ehresmann C, Nikonov S, Dumas P Crystal structure of the S15-rRNA compex // NATURE STRUCTURAL BIOLOGY.- 2000.- Vol. 7, № 4.- P. 273-275.
        14. Nikulin A, Stolboushkina E, Perederina A, Vassilieva I, Blaesi U, Moll I, Kachalova G, Yokoyama S, Vassylyev D, Garber M, Nikonov S Structure of Pseudomonas aeruginosa Hfq protein // Acta crystallogr. D.- 2005.- Vol. 61, № 2.- P. 141-146.
        15. Perederina A, Nevskaya N, Nikonov O, Nikulin A, Dumas P, Yao M, Tanaka I, Garber M, Gongadze G, Nikonov S Detailed analysis of RNA-protein interactions within the bacterial ribosomal protein L5/5S rRNA complex // RNA.- 2002.- Vol. 8, № 12.- P. 1548-1557.
        16. Stolboushkina E, Nikonov S, Nikulin A, Blasi U, Manstein DJ, Fedorov R, Garber M, Nikonov O Crystal structure of the impact archaeal translation initiation factor 2 demonstrates very high conformational flexibility in the alpha- and beta-subunits // JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY.- 2008.- Vol. 382, № 3.- P. 680-691.
        17. Tishchenko S, Kljashtorny V, Kostareva O, Nevskaya N, Nikulin A, Gulak P, Piendl W, Garber M, Nikonov S Domain II Thermus thermophilus ribosomal protein L1 hinders recognition of its mRNA // JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY.- 2008.- Vol. 383, № 2.- P. 301-305.
        18. Tishchenko S, Nikonova E, Nikulin A, Nevskaya N, Volchkov S, Piendl W, Garber M, Nikonov S Structure of the ribosomal protein L1-mRNA complex at 2.1 angstrom resolution: common features of crystal packing of L1-RNA complexes // Acta crystallogr. D.- 2006.- Vol. 62, № 12.- P. 1545-1554.
        19. Tishchenko S, Nikulin A, Fomenkova N, Nevskaya N, Nikonov O, Dumas P, Moine H, Ehresmann B, Ehresmann C, Piendl W, Lamzin V, Garber M, Nikonov S Detailed analysis of RNA-protein interactions within the ribosomal protein S8-rRNA compex from the archaeon Methanococcus jannaschii // JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY.- 2001.- Vol. 311, № 2.- P. 311-324.
        20. Unge J, Aberg A, Al-Kharadaghi S, Nikulin A, Nikonov S, Davydova NL, Nevskaya N, Garber M, Liljas A The crystal structure of ribosomal protein L22 from Thermus thermophilus: insights into the mechanism of erythromycin resistance // Structure.- 1998.- Vol. 6, № 12.- P. 1577-1586.
        21. Vassilieva IM, Nikulin AD, Blasi U, Moll I, Garber MB Crystallization of Hfq protein: a bacterial gene- expression regulator // Acta crystallogr. D.- 2003.- Vol. 59, № 6.- P. 1061-1063.
        22. Revtovich S.V., Morozova V.A., Khurs E.N., Zakomirdina L.N. Nikulin A.D., Demidkina T.V., Khomutov R.M. Three-dimensional structures of noncovalent complexes of Citrobacter freundii methionine gamma-lyase with substrates // Biochemistry-Moscow.- 2011.- Vol. 76, № 5.- P. 564-570.
        23. Ronda L., Bazulina N.P., Morozova E.A., Revtovich S.V., Chekhov V.O., Nikulin A.D., Demidkina T.V., Mozzarelli A. Exploring methionine gamma-lyase structure-function relationship via microspectrophotometry and X-ray crystallography // Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics.- 2011.- Vol. 1814, № 6 SI.- P. 834-842.
        24. Murina VN, Nikulin AD RNA-binding Sm-like proteins of bacteria and archaea. Similarity and difference in structure and function // Biochemistry-Moscow.- 2011.- Vol. 76, № 13.- P. 1434-1449
        25. Никонов СВ, Невская НА, Фоменкова НП, Никулин АД, Федоров РВ, Елисейкина ИА, Тищенко СВ, Гарбер МБ Структурные исследования бактериальных рибосомных белков // Поверхность.- 1999.- № 2.- C. 6-9.
        26. Никонов СВ, Фоменкова НП, Никулин АД, Федоров РВ, Невская НА Структура рибосомы: РНК-белковые и белок-белковые взаимодействия // Молекуляр. биология.- 1998.- T. 32, № 5.- C. 773-781.
        27. Никонова ЕЮ, Волчков СА, Кляшторный ВГ, Тищенко СВ, Костарева ОС, Невская НА, Никонов ОС, Габдулхаков АГ, Никулин АД, Давыдова НЛ, Стрельцов ВА, Гарбер МБ, Никонов СВ Кристаллические структуры мутантных форм рибосомного белка L1 // Молекуляр. биология.- 2007.- T. 41, № 4.- C. 688-696.
        28. Никулин АД Изучение взаимодействий рибосомных белков с рибосомными РНК // Успехи биологической химии.- Пущино.- 2002.- T. 42.- C. 61-88.
        29. Ревтович СВ, Никулин АД, Никонов СВ Роль N-концевой спирали во взаимодействии рибосомного белка S15 с 16S рРНК // Биохимия.- 2004.- T. 69, № 12.- C. 1619-1624.
        30. Фоменкова НП, Невская НА, Никулин АД, Никонов СВ Структурные аспекты термостабильности белков // Молекуляр. биология.- 1998.- T. 32, № 2.- C. 301-308.
        31. Ревтович СВ, Морозова ЕА, Хурс ЕН, Закомырдина ЛН, Никулин АД, Демидкина ТВ, Хомутов РМ Пространственные структуры нековалентных комплексов CYTROBACTER FREUNDII метионин-?-лиазы с субстратами // Биохимия.- 2011.- T. 76, № 5.- C. 692-700.

      Список статей
      Список грантов
      Диссертации
      Патенты
      Библиометрический анализ
      Научно-методическая деятельность

       

      НАЗАД К ОБЩЕЙ ИНФОРМАЦИИ ПО ШКОЛЕ

 

ПОИСК НАУЧНЫХ ШКОЛ

ПОИСК ПУБЛИКАЦИЙ
 

©Центральная библиотека Пущинского научного центра РАН