В Институте трудится 195 человек, из них 102 исследователя (71 научный сотрудник и 31 инженер).
В состав института входят четыре исследовательские лаборатории: механизмов биосинтеза белка, структурных исследований аппарата трансляции, биохимии вирусных РНК, физики белка;
отдел клеточной биологии, в который входят группы физиологии цитоскелета и клеточной подвижности;
11 научных групп: регуляции биосинтеза белка, генной инженерии, физики нуклеопротеидов, надмолекулярных белковых структур, термодинамики белка, структурных исследований рибосомных белков, моделирования белковых структур, химии пептидов, биоинформатики, генетики развития, спектроскопии белка.
Основными направлениями научной деятельности Института белка РАН являются: