Птицын Олег Борисович

Биография

http://www.protres.ru/templates/ipr/images/photos120x180/pticin.jpg

Олег Борисович известен в нашей стране и за рубежом как выдающийся ученый, создатель статистической физики макромолекул, основатель нового научного направления – физики белка.
В 1967 году одновременно с открытием в Пущинском научном центре Института белка Академии наук СССР была создана Лаборатория физики белка, которую возглавил Олег Борисович Птицын.
С самого начала научная деятельность в лаборатории О.Б. Птицына отличалась уникальным сочетанием экспериментальных и теоретических исследований. В сферу интересов входили столь разные научные области, как теоретическая физика, молекулярная физика и физика полимеров, прикладная и вычислительная математика, биофизика, структурная классификация макромолекул, биохимия, кинетические и термодинамические методы исследования белков, а позже – биоинформатика, белковая и генная инженерия и дизайн белковых молекул. Это сочетание, вкупе со строгим отбором новых членов лаборатории и индивидуальной работе с ними ученых старшего поколения, позволило лаборатории физики белка внести весомый, а порой и определяющий вклад в физику белка, и занять лидирующие, по общему мнению, позиции в своей области мировой науки.
Одним из наиболее известных и общепризнанных достижений О.Б. Птицына с коллегами является открытие нового конформационного состояния белковой цепи, которое ныне известно как «расплавленная глобула».
Наиболее интересные работы российской научной школы физики белка суммируются в книге А.В. Финкельштейна и О.Б. Птицына «Физика белка». Она выдержала в нашей стране 4 издания, переведена на английский, французский, китайский языки и в полной мере востребована научной, аспирантской и студенческой аудиторией в разных странах мира.
О.Б. Птицын воспитал и выпустил в свет 10 докторов наук и 31 кандидатов наук, работающих в настоящее время в России и в различных странах мира, достойно представляя за рубежом созданную в нашей стране научную школу по изучению физики белка.

Школа:Физика белка

Основатель школы: профессор Олег Борисович Птицын
Лидер школы: профессор Алексей Витальевич Финкельштейн
основные направления:

Развитие теории трехмерной структуры белков и разработка алгоритмов расчета этих структур по их аминокислотной последовательности.

Конструирование белков de-novo и белковая инженерия.

Теоретические и экспериментальные исследования основных стадий процесса сворачивания белка в функционирующую трехмерную структуру, начиная с развернутого состояния полипептидной цепи.

Основной состав школы:

• Ефимов Александр Васильевич, д.х.н., профессор, ИБ РАН
• Семисотнов Геннадий Васильевич, д.ф.-м.н., профессор, ИБ РАН
• Бычкова Валентина Егоровна, д.ф.-м.н., ИБ РАН
• Галзитская Оксана Валериановна, д.ф.-м.н., ИБ РАН
• Сурин Алексей Константинович, к.ф.-м.н., ИБ РАН
• Бражников Евгений Викторович, к.ф.-м.н., ИБ РАН
• Марченков Виктор Викторович, к.б.н., ИБ РАН
• Мельник Богдан Степанович, к.ф.-м.н., ИБ РАН
• Гарбузинский Сергей Александрович, к.ф.-м.н., ИБ РАН
• Иванков Дмитрий Николаевич, к.ф.-м.н., Германия
• Саматова Екатерина Николаевна, к.ф.-м.н., Германия
• Переяславец Леонид Борисович, к.ф.-м.н., США
• Шахнович Евгений Исаакович, к.ф.-м.н., полный профессор Гарвардского университета, США
• Мурзин Алексей Григорьевич, к.ф.-м.н., MRC LMB, Group Leader, Великобритания
• Уверский Владимир Николаевич, д.ф.-м.н., профессор, США
• Богатырева Наталья Сергеевна, к.ф.-м.н., Германия
• Балобанов Виталий Александрович, к.ф.-м.н., ИБ РАН
• Марченко Наталия Юрьевна, к.б.н., ИБ РАН
• Каргатов Антон Михайлович, к.б.н., ИБ РАН
• Гордеев Алексей Борисович, к.б.н., ИБ РАН
• Рябова Наталья Александровна, аспирант, ИБ РАН
• Довидченко Никита Владимирович, аспирант, ИБ РАН
• Катина Наталья Сергеевна, аспирант, ИБ РАН
• Евдокимов Станислав Рудольфович, аспирант, ИБ РАН
• Глякина Анна Владимировна, аспирант, ИБ РАН
• Бошкова Евгения Александровна, аспирант, ИБ РАН
• Дудина Мария Анатольевна, аспирант, ИБ

Наиболее значимые научные труды О.Б. Птицына.

• Птицын О.Б.  Самоорганизация белковых молекул. Вестник АН СССР (1973) №5, 57-68.
• Птицын О.Б. Стадийный механизм самоорганизации белковых молекул. Докл. АН СССР (1973) 210, №5, 1213-1215.
• Schulz G.E., Barry C.D., Friedman J., Chou P.Y., Fasman G.D., Finkelstein A.V., Lim V.I., Ptitsyn O.B., Kabat E.A., Wu T.T., Levitt M., Robson B., Nagano K. Comparison of predicted and experimentally determined secondary structure of adenylate kinase. Nature (1974) 250, №5462, 140-142.
• Ptitsyn O.B. Invariant features of globin primary structure and coding of their secondary structure. J. Mol. Biol. (1974) 88, №2, 287-300.
• Finkelstein A.V., Ptitsyn O.B. A theory of protein molecule self-organisation. IV. Helical and irregular local structures of unfolded protein chains. J. Mol. Biol. (1976) 103, №1, 15-24.
• Ptitsyn O.B., Finkelstein A.V. Mechanism of protein folding. Int. J. Quant. Chem. (1979) 16, №3, 407-418.
• Dolgikh D.A., Gilmanshin R.I., Brazhnikov E.V., Bychkova V.E.,
• Semisotnov G.V., Venyaminov S.Yu., Ptitsyn O.B. Alpha-lactalbumin: compact state with fluctuating tertiary structure? FEBS Lett. (1981) 136, №2, 311-315.
• Ptitsyn O.B., Finkelstein A.V. Similarities of protein topologies: evolutionary divergence, functional convergence or principles of folding? Quart. Rev. Biophys. (1980) 13, №3, 339-386.
• Ptitsyn O.B. Protein as an "edited" statistical copolymers? In: “Conformation in Biology” (R.Srinivasan and R.H.Sarma, eds.), Adenine Press, N.-Y., 1983, 49-58.
• Ptitsyn O.B., Finkelstein A.V. Theory of protein secondary structure and algorithm of its prediction. Biopolymers (1983) 22, №1, 15-25.
• Птицын О.Б. Физические принципы белковых структур. Усп. физ. наук (1983) 141, №3, 547-549.
• Ptitsyn O.B. Protein folding: general physical model. FEBS Lett. (1981) 131, №2, 197-202.
• Dolgikh D.A., Kolomiets A.P., Bolotina I.A., Ptitsyn O.B. "Molten globule" state accumulates in carbonic anhydrase folding. FEBS Lett. (1984) 165, №1, 88-92.
• Dolgikh D.A., Abaturov L.V., Bolotina I.A., Brazhnikov E.V., Bychkova V.E., Bushuev V.N., Gilmanshin R.I., Lebedev Yu.O., Semisotnov G.V., Tiktopulo E.I., Ptitsyn O.B. Compact state of a protein molecule with pronounced small-scale mobility: bovine alpha-lactalbumin. Eur. Biophys. J. (1985) 13, №2, 109-121.
• Ptitsyn O.B., Volkenstein M.V. Protein structures and neutral theory of evolution. J. Biomol. Struct. Dynam. (1986) 4, №1, 137-156.
• Ptitsyn O.B. Protein folding: hypothesis and experiments. (Review). J. Protein Chem. (1987) 6, №4, 273-293.
• Semisotnov G.V., Rodionova N.A., Kutyshenko V.P., Ebert B., Blank J., Ptitsyn O.B. Sequential mechanism of refolding of carbonic anhydrase B. FEBS Lett. (1987) 224, №1, 9-13.
• Finkelstein A.V., Ptitsyn O.B. Why do globular proteins fit the limited set of folding patterns? Progr. Biophys. Mol. Biol. (1987) 50, 171-190.
• Финкельштейн А.В., Кирпичников М.П., Птицын О.Б., Скрябин К.Г. Конструирование белковых молекул. Вестник АН СССР (1988) №3, 102-111.
• Ptitsyn O.B., Pain R.H., Semisotnov G.V., Zerovnik E., Razgulyaev O.I. Evidence for a molten globule state as a general intermediate in protein folding. FEBS Lett. (1990) 262, №1, 20-24.
• Finkelstein A.V., Badretdinov A.Ya., Ptitsyn O.B. Short alpha-helix stability. Nature (1990) 345, №6273, 300-300.
• Ptitsyn O.B., Semisotnov G.V. Mechanism of protein folding. In: “Conformations and Forces in Protein Folding” (B.T.Nall, K.A.Dill, eds.). Amer. Assoc. Adv. Sci., Washington, D.C., 1991, 155-168.
• Ptitsyn O.B., Finkelstein A.V. Prediction of protein secondary structure based on physical theory. Histones. Protein Eng. (1989) 2, №6, 443-447.
• Ptitsyn O.B. How does protein synthesis give rise to the 3D-structure? (Review). FEBS Lett. (1991) 285, №2, 176-181.
• Ptitsyn O.B. Secondary structure formation and stability. (Review). Curr. Opin. Struct. Biol. (1992) 2, №1, 13-20.
• Fedorov A.N., Dolgikh D.A., Chemeris V.V., Chernov B.K., Finkelstein A.V., Schulga A.A., Alakhov Yu.B., Kirpichnikov M.P., Ptitsyn O.B. De novo design, synthesis and study of albebetin, a polypeptide with a predetermined three-dimensional structure. Probing the structure at the nanogram level. J. Mol. Biol. (1992) 225, №4, 927-931.
• Ptitsyn O.B. The molten globule state. (Review). In: "Protein Folding" (T.E.Creighton, ed.), W.H. Freeman & Co., N.-Y., 1992, 243-300.
• Uversky V.N., Semisotnov G.V., Pain R.H., Ptitsyn O.B. "All-or-none" mechanism of the molten globule unfolding. FEBS Lett. (1992) 314, №1, 89-92.
• Ptitsyn O.B. Structures of folding intermediates. (Review). Curr. Opin. Struct. Biol. (1995) 5, №1, 74-78.
• Bychkova V.E., Ptitsyn O.B. Folding intermediates are involved in genetic diseases? (Hypothesis). FEBS Lett. (1995) 359, №1, 6-8.
• Ptitsyn O.B., Bychkova V.E., Uversky V.N. Kinetic and equilibrium folding intermediates. (Review). Phil. Trans. Royal Soc. (London), Ser. B (1995) 348, №1323, 35-41.
• Ptitsyn O.B. Molten globule and protein folding. (Review). Adv. Protein Chem. (1995) 47, 83-229.
• Ptitsyn O.B. How the molten globule became. (Review). Trends Biochem. Sci. (1995) 20, №9, 376-379.
• Shakhnovich E.I., Abkevich V.I., Ptitsyn O.B. Conserved residues and the mechanism of protein folding. Nature (1996) 379, №6560, 96-98.
• Ptitsyn O.B. Protein folding and protein evolution: common folding nucleus in different subfamilies of c-type cytochromes? J. Mol. Biol. (1998) 278, №3, 655-666.
• Ptitsyn O.B. How molten is the molten globule? Nature Struct. Biol. (1996) 3, 488-490.
• Dolgikh D.A., Fedorov A.N., Finkelstein A.V., Ptitsyn O.B., Skryabin K.G., Kirpichnikov M.P. Protein engineering of albebetin, a de novo protein with a predesigned three-dimensional structure. In: “Molecular Manufacturing” (C.Nicolini, ed.). Plenum Press, N.-Y., 1996, 101-114.
• Ptitsyn O.B. Protein evolution and protein folding: non-functional conserved residues and their probable role. In: BIOCOMPUTING’99. Proc. of the 1999 Pacific Symposium (R.B.Altman, A.K.Dunkel, L.Hunter, T.E.Klein, K.Lauderdale, eds.), WSP Co. Pte. Ltd., Mauna Lani, Hawaii, USA, 4-9 January, 1999, 494-504.
• Dobson C.M., Ptitsyn O.B. Folding and binding. From theory to therapy. Curr. Opin. Struct. Biol. (1997) 7, №1, 1-2.
• Ptitsyn O.B., Bychkova V.E., Dujsekina A.E., Rossi G.-L, Fantuzzi A., Uversky V.N., Tiktopulo E.I., Klenin S.I. Modeling of the molten globule state of proteins near membranes. Protein Eng. (1997) 10, Suppl., 32.
• Ptitsyn O.B., Ting K.-L.H. Non-functional conserved residues in globins and their possible role as a folding nucleus. J. Mol. Biol. (1999) 291, №3, 671-682

 

 

Список статей
Список грантов
Диссертации
Патенты
Библиометрический анализ
Научно-методическая деятельность

 

НАЗАД К ОБЩЕЙ ИНФОРМАЦИИ ПО ШКОЛЕ